Como todas las bacterias tienen endonucleasas de restricción para combatir la invasión de ADN extraño, un mecanismo para proteger su propio ADN es esencial. Una solución inteligente a este problema de un corte de nucleasa de restricción su propio ADN es metilar ADN en cada secuencia del sitio objetivo usando un compañero restricción metilasa. Los grupos metilo distorsionan el sitio activo de la endonucleasa de restricción. e inhibe su actividad para que el ADN no sea digerido. Por lo tanto, esta modificación protege el ADN bacteriano de la digestión. por su propia endonucleasa y se introduce durante el proceso de replicación, evitando digestión del ADN organismal. Este emparejamiento de metilasa y nucleasa proporciona un organismo unicelular expuesto al ADN y al medio ambiente, un mecanismo tanto para digerir el ADN extraño invasor como para proteger su propio ADN. Como hemos discutido, las endonucleasas de restricción, a menudo se les conoce como enzimas de restricción, tener una amplia gama de secuencias objetivo de modo que cuando ocurre la digestión de una muestra de ADN, hay múltiples fragmentos.
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